Protein–RNA interactions for Protein: P58417

NXPH1, Neurexophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH1P58417 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXPH1P58417 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPH1P58417 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH1P58417 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms