Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AIF1P55008 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AIF1P55008 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AIF1P55008 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AIF1P55008 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AIF1P55008 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AIF1P55008 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AIF1P55008 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AIF1P55008 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIF1P55008 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIF1P55008 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIF1P55008 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AIF1P55008 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AIF1P55008 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AIF1P55008 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AIF1P55008 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AIF1P55008 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AIF1P55008 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIF1P55008 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIF1P55008 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIF1P55008 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIF1P55008 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms