Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMP3P54852 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMP3P54852 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMP3P54852 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EMP3P54852 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMP3P54852 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMP3P54852 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EMP3P54852 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMP3P54852 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMP3P54852 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMP3P54852 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMP3P54852 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMP3P54852 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms