Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC12P31275 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms