Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CA4P22748 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CA4P22748 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CA4P22748 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CA4P22748 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CA4P22748 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CA4P22748 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CA4P22748 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CA4P22748 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CA4P22748 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA4P22748 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA4P22748 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA4P22748 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA4P22748 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA4P22748 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA4P22748 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CA4P22748 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CA4P22748 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CA4P22748 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CA4P22748 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CA4P22748 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA4P22748 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA4P22748 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA4P22748 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA4P22748 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA4P22748 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA4P22748 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CA4P22748 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CA4P22748 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CA4P22748 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms