Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX1P22670 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX1P22670 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX1P22670 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX1P22670 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX1P22670 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX1P22670 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX1P22670 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX1P22670 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX1P22670 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX1P22670 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX1P22670 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX1P22670 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX1P22670 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX1P22670 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX1P22670 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX1P22670 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX1P22670 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX1P22670 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX1P22670 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX1P22670 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX1P22670 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX1P22670 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX1P22670 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX1P22670 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX1P22670 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX1P22670 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms