Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PVALBP20472 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PVALBP20472 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PVALBP20472 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PVALBP20472 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PVALBP20472 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PVALBP20472 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PVALBP20472 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PVALBP20472 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PVALBP20472 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PVALBP20472 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PVALBP20472 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PVALBP20472 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PVALBP20472 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PVALBP20472 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PVALBP20472 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PVALBP20472 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PVALBP20472 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms