Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME1P15531 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME1P15531 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME1P15531 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME1P15531 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME1P15531 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NME1P15531 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME1P15531 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME1P15531 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME1P15531 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME1P15531 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME1P15531 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME1P15531 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME1P15531 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME1P15531 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME1P15531 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME1P15531 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME1P15531 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME1P15531 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME1P15531 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME1P15531 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME1P15531 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME1P15531 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME1P15531 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME1P15531 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME1P15531 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NME1P15531 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME1P15531 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME1P15531 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME1P15531 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME1P15531 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME1P15531 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME1P15531 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME1P15531 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME1P15531 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME1P15531 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME1P15531 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME1P15531 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NME1P15531 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME1P15531 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms