Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFD2P13995 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms