Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMBSP08397 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMBSP08397 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HMBSP08397 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMBSP08397 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBSP08397 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBSP08397 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBSP08397 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBSP08397 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBSP08397 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMBSP08397 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMBSP08397 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMBSP08397 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMBSP08397 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMBSP08397 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMBSP08397 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMBSP08397 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMBSP08397 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBSP08397 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBSP08397 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBSP08397 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBSP08397 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBSP08397 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBSP08397 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBSP08397 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBSP08397 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBSP08397 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBSP08397 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBSP08397 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBSP08397 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBSP08397 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBSP08397 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBSP08397 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBSP08397 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBSP08397 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBSP08397 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBSP08397 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBSP08397 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBSP08397 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBSP08397 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBSP08397 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBSP08397 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBSP08397 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMBSP08397 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMBSP08397 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMBSP08397 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMBSP08397 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMBSP08397 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMBSP08397 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMBSP08397 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBSP08397 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBSP08397 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBSP08397 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBSP08397 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBSP08397 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBSP08397 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBSP08397 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBSP08397 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBSP08397 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBSP08397 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBSP08397 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBSP08397 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBSP08397 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBSP08397 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBSP08397 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBSP08397 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBSP08397 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBSP08397 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBSP08397 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBSP08397 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBSP08397 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 542 ms