Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM3P06753 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM3P06753 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM3P06753 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPM3P06753 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPM3P06753 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM3P06753 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM3P06753 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM3P06753 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM3P06753 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM3P06753 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM3P06753 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM3P06753 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM3P06753 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM3P06753 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM3P06753 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM3P06753 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM3P06753 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM3P06753 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM3P06753 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM3P06753 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM3P06753 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM3P06753 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM3P06753 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM3P06753 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM3P06753 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM3P06753 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM3P06753 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM3P06753 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM3P06753 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM3P06753 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM3P06753 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM3P06753 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM3P06753 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM3P06753 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM3P06753 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM3P06753 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM3P06753 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM3P06753 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM3P06753 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM3P06753 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM3P06753 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM3P06753 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM3P06753 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM3P06753 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM3P06753 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM3P06753 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM3P06753 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM3P06753 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM3P06753 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM3P06753 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM3P06753 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM3P06753 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms