Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCBP05771 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms