Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNAP02545 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNAP02545 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNAP02545 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNAP02545 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNAP02545 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNAP02545 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNAP02545 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNAP02545 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNAP02545 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNAP02545 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNAP02545 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNAP02545 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNAP02545 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMNAP02545 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMNAP02545 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNAP02545 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNAP02545 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNAP02545 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNAP02545 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNAP02545 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNAP02545 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNAP02545 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNAP02545 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNAP02545 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNAP02545 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNAP02545 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNAP02545 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNAP02545 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNAP02545 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNAP02545 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNAP02545 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNAP02545 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNAP02545 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNAP02545 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNAP02545 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNAP02545 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNAP02545 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNAP02545 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNAP02545 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNAP02545 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNAP02545 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNAP02545 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms