Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE2O96020 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE2O96020 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms