Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED1O96006 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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