Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3BO95985 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3BO95985 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms