Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms