Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3BO75182 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms