Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLIN3O60664 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLIN3O60664 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLIN3O60664 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.5 ms