Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD6O60522 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TDRD6O60522 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms