Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1GO43497 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1GO43497 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1GO43497 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1GO43497 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1GO43497 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1GO43497 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1GO43497 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1GO43497 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1GO43497 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1GO43497 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1GO43497 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1GO43497 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1GO43497 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1GO43497 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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