Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KRW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KRW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KRW8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KRW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3KRW8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KRW8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KRW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KRW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KRW8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KRW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KRW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KRW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KRW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3KRW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3KRW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3KRW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
J3KRW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3KRW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3KRW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3KRW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KRW8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KRW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3KRW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3KRW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3KRW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3KRW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3KRW8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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