Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RCCD1A6NED2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCCD1A6NED2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms