Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y4

PTGDR2, Prostaglandin D2 receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDR2Q9Y5Y4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDR2Q9Y5Y4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGDR2Q9Y5Y4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGDR2Q9Y5Y4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms