Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX13Q9Y5W8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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SNX13Q9Y5W8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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SNX13Q9Y5W8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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SNX13Q9Y5W8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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SNX13Q9Y5W8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX13Q9Y5W8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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