Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXND1Q9Y4D7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms