Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms