Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS3Q9UPU3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORCS3Q9UPU3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS3Q9UPU3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms