Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAL4Q9UM19 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAL4Q9UM19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAL4Q9UM19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAL4Q9UM19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPCAL4Q9UM19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPCAL4Q9UM19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPCAL4Q9UM19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HPCAL4Q9UM19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPCAL4Q9UM19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms