Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFDP1Q9UEE9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CFDP1Q9UEE9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CFDP1Q9UEE9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms