Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms