Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACSIN1Q9BY11 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PACSIN1Q9BY11 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms