Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1QTNF1Q9BXJ1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms