Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC94Q9BW85 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC94Q9BW85 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms