Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM106CQ9BVX2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM106CQ9BVX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms