Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP250Q9BV73 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP250Q9BV73 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP250Q9BV73 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms