Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSG1Q9BU20 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms