Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM42Q9BTD8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM42Q9BTD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms