Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD5Q99717 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms