Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUDCD1Q96RS6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms