Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E2Q96LR5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE2E2Q96LR5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms