Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SENP8Q96LD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SENP8Q96LD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP8Q96LD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms