Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
SIRT1Q96EB6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIRT1Q96EB6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SIRT1Q96EB6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms