Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOPBP1Q92547 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TOPBP1Q92547 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC39■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC39■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOPBP1Q92547 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 998.7 ms