Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3LQ8TDB6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DTX3LQ8TDB6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms