Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf20Q8ND61 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf20Q8ND61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf20Q8ND61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C3orf20Q8ND61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf20Q8ND61 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms