Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC191Q8NCU4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC191Q8NCU4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC191Q8NCU4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC191Q8NCU4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC191Q8NCU4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC191Q8NCU4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC191Q8NCU4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC191Q8NCU4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC191Q8NCU4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms