Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARP9Q8IXQ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms