Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR53Q7Z5U6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms