Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
STRCQ7RTU9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms